Programmet indebærer 6 ansøgningsrunder fra 2008 til 2013, hvorefter programmet fortsat drives i fire år med henblik på at følge samtlige bevilgede projekter i mål. Fordelingen af midler er som vist i figuren

Det samlede bidrag fra EU Kommissionen er på 450 mio. euro. Hertil lægges projektdeltagernes egenfinansiering på yderligere 450 mio. euro, således at den samlede investering i brint og brændselsceller i EU regi summerer op til ca. 900 mio. euro eller ca. 6,8 mia. danske kroner.

Fordelingen af midler igennem perioden er udtryk for en forventet udvikling af teknologierne frem mod demonstration og marked.