I Danmark findes der flere aktører, som samarbejder med det europæiske brint og brændselscelleprogram. Dette både ved at levere indspil direkte til programkontoret samt til at hjælpe danske interessenter i en ansøgningsproces.

Sekretariatet deltager på myndighedernes vegne i møder i States Representatives Group, hvor direktør Aksel Mortensgaard er næstformand. Desuden er Partnerskabet koordinator på et projekt, med formål at øge den danske deltagelse i projekter under FCH JU.  

EuroCenter er som nationalt kontaktpunkt i kontakt med FCH JU. I EuroCenter arbejder man med at rådgive og informere projektdeltagere, både i en ansøgningsproces, samt i forbindelse med administration af projekter. Desuden er EuroCenter meget engagerede i det 7. rammeprogram, hvor der ligeledes er muligheder for at ansøge om projektmidler.
EuroCenter har mulighed for at støtte ansøgere til FCH JU med støtteprogrammet EUopSTART. Her er det muligt for danske virksomheder og vidensinstitutioner at søge tilskud til det forberedende arbejde med at deltage i udvalgte forskningsprogrammer, herunder Fuel Cells and Hydrogen Joint Undertaking. 
EuroCenter er meget interesserede i at støtte danske aktører i EU og kan kontaktes for råd og vejledning.
Fuldmægtig Tina Sander er blandt andet national kontaktperson (NCP) for FCH JU og kan kontaktes for yderligere information om EUopSTART mv.